Sars-Cov-2, une étude étudie sa propagation dans la nature

Si, dès le début de la pandémie, il semblait que le Sars-Cov-2 s’était propagé principalement parmi les visons domestiques, de zoo et d’élevage, les rapports montrent une propagation abondante du virus également dans la faune sauvage. L’avertissement vient d’Amérique du Nord, où un nombre croissant de cerfs de Virginie ont été testés positifs au virus.

Il s’agit du cervidé prédominant dans la région, ce qui suscite de grandes inquiétudes parmi les populations locales. Le risque, en effet, est qu’il évolue vers de nouvelles variantes qui pourraient à nouveau affecter l’espèce humaine, déclenchant de nouvelles vagues de maladies.

Kurt Vandegrift est celui qui veut étudier comment l’agent pathogène se propage parmi les animaux. Écologiste à l’Université d’État de Pennsylvanie, il dirige désormais l’un des plus grands programmes mondiaux de surveillance de la faune sauvage pour le Sars-Cov-2. Dans son travail, il vise à collecter et analyser plus de 24 000 échantillons de 58 espèces sauvages au cours des deux prochaines années. En fait, les cerfs ne sont pas les seuls à pouvoir contracter le virus.

Les programmes de gestion de la faune en Californie et en Alaska enverront à Vandegrift des échantillons prélevés sur le renard, l’ours, le lapin, le castor et l’orignal. Les chasseurs des deux zones géographiques ont accepté de lui fournir des prélèvements de cerfs mulets, de coyotes, de lynx roux et de martres, un carnivore semblable à la belette. Une entreprise de lutte antiparasitaire fournira des échantillons d’opossums, de rats, de ratons laveurs et de mouffettes provenant de 10 villes. Les réseaux de réhabilitation de la faune enverront des échantillons de cerfs de Virginie, de musaraignes, de belettes et d’écureuils. Vandegrift prévoit également de capturer personnellement des campagnols, des marmottes, des écureuils et des porcs-épics.

Il sera évalué s’ils sont actuellement infectés ou s’ils ont développé des anticorps, signe d’une infection antérieure. Cela permettra de mieux comprendre la menace que représente le virus pour les animaux et l’espèce humaine, en cas de mutations spécifiques.

Les signalements du virus dans la faune sauvage sont relativement rares, en partie parce que la surveillance est difficile et inégale. Jusqu’à présent, les détections ont été réalisées par une équipe française, qui a trouvé des anticorps contre le virus chez des blaireaux et des martres. Au Brésil, deux coatis, mammifères semblables aux ratons laveurs, ont été infectés. En Inde, un léopard a été testé positif au virus, tandis qu’au Sénégal, la présence du Covid-19 a été détectée chez un rhinocéros blanc.

Il existe actuellement environ 50 espèces animales reconnues comme sensibles au Sars-Cov-2.

La cause pourrait être en partie attribuée à une protéine, l’enzyme de conversion de l’angiotensine 2 (Ace2), hautement conservée chez toutes les espèces et exprimée chez les animaux ayant montré leur capacité à contracter l’infection. Sa présence permet au virus de se propager dans les cellules hôtes via des récepteurs compatibles et, dans certains cas, la transmission entre différentes espèces.

Il est cependant important de faire la distinction entre les « hôtes sans issue » et les « hôtes d’amplification » : les infections de populations d’hôtes qui ne transmettent pas efficacement l’agent pathogène, également appelées hôtes « sans issue », peuvent rapidement conduire à l’extinction de l’agent pathogène. virus au sein de cette population. Les chiens, qui sont sensibles à l’infection par le Sars-CoV2 mais ne transmettent pas efficacement le virus, en sont un exemple. On parle cependant d’hôtes d’amplification en référence aux organismes dans lesquels le virus parvient à proliférer de manière indiscrète, présentant un risque de transmission à d’autres hôtes.

Vandergrift n’est pas le seul à avoir remarqué une propagation croissante du virus dans certaines populations d’animaux sauvages. Une autre étude récente, portant également sur le cerf de Virginie, révèle qu’environ 40 % des animaux en liberté aux États-Unis ont développé des anticorps contre le Sars-Cov-2.

Étonnamment, dans un travail mené par Kuchipudi, professeur de microbiologie et de maladies infectieuses à l’université de Pittsburgh, il apparaît que l’homme serait un possible « hôte d’amplification » du virus, qu’il transmettrait ensuite aux animaux. L’étude implique une fois de plus des cerfs et montre que l’infection des animaux est le résultat de multiples événements de zoonose inverse (ou anthroponose) provenant d’humains, suivis d’une transmission efficace de cerf à cerf.

Le BoLive il en avait déjà parlé dans un article précédent : d’après une étude, publiée le Écologie et évolution de la nature, il s’avère qu’il existe d’innombrables infections que les humains transmettent aux animaux. En analysant les séquences virales disponibles, les scientifiques ont retracé les voies par lesquelles les virus se propagent entre les espèces de vertébrés, découvrant que les humains jouent un rôle important dans la transmission des infections à des espèces autres que la nôtre.

L’image traditionnelle présente l’espèce humaine comme la destination finale de diverses maladies, mais néglige souvent un aspect important : le rôle actif qu’elle joue dans la transmission d’agents pathogènes à d’autres espèces. On sait par exemple que les zoonoses, les maladies que les animaux transmettent à l’homme, sont à l’origine de 60 % des maladies infectieuses de l’espèce humaine que nous connaissons, alors que nous savons très peu de choses sur les anthroponoses.

Des animaux tels que des visons, des chats et des chiens domestiques ont été infectés par la zoonose inversée à plusieurs reprises et tous, à l’exception des chiens, semblent capables de transmettre le Sars-Cov-2 entre eux ou potentiellement aux humains.

Le fait que certains animaux puissent servir de réservoirs au virus et accumuler des mutations susceptibles d’influencer sa pathogénicité est certes inquiétant. Ce scénario fait craindre que le Sars-Cov-2 puisse revenir chez l’homme avec de nouvelles variantes qui pourraient compromettre l’immunité acquise jusqu’à présent.

Il est donc nécessaire d’adopter une approche intégrée UneSantéqui vise à prévenir et à répondre aux pandémies grâce à une collaboration entre différents secteurs, notamment la santé publique, la santé vétérinaire et l’environnement.

Pour faire face aux menaces de futures retombées zoonotiques, où les animaux transmettent des infections, et à la propagation de maladies émergentes, il est essentiel de comprendre les dynamiques sociales et environnementales qui favorisent de tels événements. Cela implique non seulement la surveillance des maladies chez l’homme et l’animal, mais aussi l’adoption de mesures de prévention et de contrôle fondées sur les connaissances scientifiques et l’analyse des facteurs qui favorisent la transmission inter-espèces des virus.

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