avait développé une nouvelle variante (avec plus de 50 mutations)

Un cas clinique extraordinaire émerge aux Pays-Bas, où un homme de 72 ans est décédé après avoir vécu avec le Covid-19 pendant 613 jours, la plus longue période d’infection jamais documentée. Durant cette période, le virus a subi des évolutions significatives, aboutissant à un variant hautement muté et potentiellement immuno-évasif. Le cas sera discuté en détail lors du Congrès mondial ESCMID 2024, un événement majeur en microbiologie clinique et en maladies infectieuses.

L’affaire

Le Néerlandais, qui souffrait de graves affections sous-jacentes, notamment du syndrome myélodysplasique-myéloprolifératif traité par une allogreffe de cellules souches, était extrêmement immunodéprimé. Le lymphome diffus à grandes cellules B, traité au rituximab, un médicament qui élimine les cellules B, normales et malignes, complique encore davantage son tableau clinique. Cela a considérablement réduit sa capacité à produire des anticorps contre le Sars-Cov-2, bien qu’il ait reçu plusieurs doses du vaccin.

L’évolution du virus

Au cours de son hospitalisation au centre médical de l’Université d’Amsterdam, un traitement avec des anticorps monoclonaux et d’autres médicaments antiviraux a été tenté, sans succès pour éradiquer le virus. Vingt et un jours après le traitement, une mutation du virus était évidente, conférant une résistance au sotrovimab, l’anticorps monoclonal utilisé. Le séquençage du virus a révélé plus de 50 mutations par rapport aux variantes contemporaines d’Omicron, y compris des changements significatifs dans la protéine Spike, pertinents pour la capacité du virus à contourner le système immunitaire.

Qu’est-ce qu’il enseigne

Cette affaire est particulièrement significative pour plusieurs raisons. Premièrement, cela démontre comment, chez un patient gravement immunodéprimé, le Covid-19 peut non seulement persister, mais également évoluer de manière à échapper aux défenses immunitaires généralement activées. En outre, l’affaire met en évidence les risques associés à la possibilité que des variantes immuno-évasives émergent de contextes cliniques similaires, similaires à ce qui serait arrivé avec la variante Omicron. Bien que le variant du virus chez ce patient n’ait pas provoqué de transmission à des cas secondaires, son développement suscite des inquiétudes quant à la capacité des infections persistantes à générer de nouveaux variants qui remettent en question les mécanismes de protection existants.

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